Después de que la humanidad triunfa sobre las peligrosas puertas, se restaura una frágil paz, pero los inmensos poderes de los espers se convierten en una peligrosa espada de doble filo. En el corazón de esta confusión está Esper Zero, Michael, tambaleando al borde de la destrucción. Entra Adam, un soldado retirado perseguido por los lazos rotos entre los expertos y sus guías. En un audaz acto de redención, Adam le ofrece a Michael una segunda oportunidad y una nueva identidad: "Eve", que simboliza un nuevo comienzo y una chispa de esperanza. Pero, ¿es la paz realmente posible para una persona creada para la guerra...?